biobakery_workflows wmgx --input ./ --output …/workflow_output/ --bypass-strain-profiling
(Mar 30 12:17:04) [ 1/21 - 4.76%] ** Skipped ** Task 8: metaphlan_count_species
(Mar 30 12:17:04) [ 2/21 - 9.52%] **已跳过 ** 任务 7：metaphlan_join_taxonomic_profiles
（3 月 30 日 12:17:04）[3/21 - 14.29%] **已跳过 ** 任务 5：metaphlan____SRR13300632
(3 月 30 日 12:17:04) [ 4/21 - 19.05%] **已跳过 ** 任务 4：kneaddata_read_count_table
(3 月 30 日 12:17:04) [ 5/21 - 23.81%] **已跳过 ** 任务 0 : kneaddata____SRR13300632
(Mar 30 12:17:04) [ 5/21 - 23.81%] **Ready ** Task 9: humann____SRR13300632
(Mar 30 12:17:04) [ 5/21 - 23.81%] **Started **任务 9：人类____SRR13300632
（3 月 30 日 12:17:07）[6/21 - 28.57%] **失败 ** 任务 9：humann____SRR13300632
（3 月 30 日 12:17:07）[7/21 - 33.33%] **失败 ** 任务 11 ：humann_count_alignments_species
（3 月 30 日 12:17:07）[8/21 - 38.10%] **失败 ** 任务 12：humann_regroup_UniRef2EC____SRR13300632
（3 月 30 日 12:17:07）[9/21 - 42.86%] 失败任务 14：humann_join_tables_ecs
（3 月 30 日 12:17:07）[10/21 - 47.62%] **失败 ** 任务 17：humann_renorm_ecs_relab____SRR13300632
（3 月 30 日 12:17:07）[11/21 - 52.38%] 失败 任务 20：humann_join_tables_ecs_relab
（3 月 30 日 12:17:07）[12/21 - 57.14%] **失败 ** 任务 23：humann_count_features_ecs
（3 月 30 日 12:17:07）[13/21 - 61.90%] * *失败 ** 任务 13：humann_join_tables_genefamilies
（3 月 30 日 12:17:07）[14/21 - 66.67%] **失败 ** 任务 15：humann_join_tables_pathabundance
（3 月 30 日 12:17:07）[15/21 - 71.43%] **失败 ** 任务 16 ：humann_renorm_genes_relab____SRR13300632
（3 月 30 日 12:17:07）[16/21 - 76.19%] **失败 ** 任务 19：humann_join_tables_genes_relab
（3 月 30 日 12:17:07）[17/21 - 80.95%] **失败 **任务 22：humann_count_features_genes
（3 月 30 日 12:17:07）[18/21 - 85.71%] **失败 ** 任务 18：humann_renorm_pathways_relab____SRR13300632
（3 月 30 日 12:17:07）[19/21 - 90.48%] 失败 任务 21：humann_join_tables_pathways_relab
（3 月 30 日 12:17:07）[20/21 - 95.24%] **失败 ** 任务 24：humann_count_features_pathways
（3 月 30 日 12:17:07）[21/21 - 100.00%] * *失败 ** 任务 25：humann_merge_feature_counts
运行已完成的
任务 9 失败
名称：humann____SRR13300632
原始错误：
执行操作 0 时出错。原始异常：
回溯（最近一次调用最后一次）：
文件“/home/lk/.local/lib/python3.7/site-packages/anadama2/runners .py”，第 201 行，在 _run_task_locally
action_func(task)
文件“/home/lk/.local/lib/python3.7/site-packages/anadama2/helpers.py”，第 89 行，在 实际上
_sh ret = _sh(s , **kwargs)
文件“/home/lk/.local/lib/python3.7/site-packages/anadama2/util/init .py ”，第 320 行，在 sh 中
引发 ShellException(proc.returncode, msg.format( cmd, ret[0], ret[1]))
anadama2.util.ShellException: [Errno 1] 命令`humann --input /home/lk/PRJNA685168/workflow_output/kneaddata/main/SRR13300632.fastq --output /home/lk/PRJNA685168/workflow_output/humann/main --o -log /home/lk/PRJNA685168/workflow_output/humann/main/SRR13300632.log --threads 1 --taxonomic-profile /home/lk/PRJNA685168/workflow_output/metaphlan/main/SRR13300632_taxonomic_profile.tsv ‘失败。
Out: b’输出文件将被写入：/home/lk/PRJNA685168/workflow_output/humann/main\n’
Err: b’CRITICAL ERROR: 找不到 Diamond 可执行文件。请检查安装。\n’
嗨，这个过程花了我很长时间，但显示失败，
希望你回答。
